Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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