Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
STRN3Q13033 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STRN3Q13033 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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