Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM2Q13029 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM2Q13029 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
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