Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK3Q13003 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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