Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TWF1Q12792 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms