Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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KCNMA1Q12791 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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KCNMA1Q12791 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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KCNMA1Q12791 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNMA1Q12791 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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