Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC173Q0VFZ6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms