Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBRQ0VD83 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms