Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC15Q0P6D6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms