Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LOXL1Q08397 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LOXL1Q08397 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms