Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPCQ03188 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms