Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSG1Q02413 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms