Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTUD4Q01804 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms