Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VLDLRP98155 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VLDLRP98155 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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