Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NOMO3P69849 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms