Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ERVS71-1P61550 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ERVS71-1P61550 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms