Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPS3AP61247 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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