Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBASH3AP57075 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms