Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BGRP55822 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BGRP55822 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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