Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms