Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCT5P48643 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCT5P48643 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCT5P48643 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms