Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABRA4P48169 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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GABRA4P48169 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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GABRA4P48169 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA4P48169 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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