Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNPDA1P46926 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms