Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFSF9P41273 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms