Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LTBRP36941 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LTBRP36941 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LTBRP36941 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LTBRP36941 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LTBRP36941 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LTBRP36941 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LTBRP36941 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LTBRP36941 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LTBRP36941 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LTBRP36941 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms