Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GJC1P36383 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms