Protein–RNA interactions for Protein: P35914

HMGCL, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLP35914 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGCLP35914 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms