Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms