Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXA13P31271 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms