Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMBRP28336 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMBRP28336 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMBRP28336 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMBRP28336 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMBRP28336 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMBRP28336 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMBRP28336 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMBRP28336 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMBRP28336 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMBRP28336 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NMBRP28336 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NMBRP28336 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms