Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BGNP21810 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BGNP21810 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BGNP21810 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms