Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ITGB4P16144 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms