Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF1P10914 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF1P10914 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF1P10914 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF1P10914 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF1P10914 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF1P10914 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF1P10914 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF1P10914 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF1P10914 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF1P10914 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRF1P10914 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRF1P10914 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF1P10914 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF1P10914 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF1P10914 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF1P10914 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF1P10914 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF1P10914 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF1P10914 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF1P10914 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF1P10914 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF1P10914 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF1P10914 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF1P10914 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF1P10914 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF1P10914 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRF1P10914 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms