Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms