Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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