Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
KIF1CO43896 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms