Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGSM2O43147 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms