Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms