Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP17L12C9JPN9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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USP17L12C9JPN9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP17L12C9JPN9 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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