Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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C4orf47A7E2U8 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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C4orf47A7E2U8 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C4orf47A7E2U8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C4orf47A7E2U8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C4orf47A7E2U8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf47A7E2U8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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C4orf47A7E2U8 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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C4orf47A7E2U8 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4orf47A7E2U8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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