Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F8A0AVK6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms