Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNPO3Q9Y5L0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms