Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms