Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
REXO2Q9Y3B8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms