Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP20Q9Y2K6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP20Q9Y2K6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms