Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH7Q9ULB5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms