Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNMT3BQ9UBC3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms