Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATAD3AQ9NVI7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATAD3AQ9NVI7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms