Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LMBRD1Q9NUN5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms