Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCC13Q9NSE7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms